Une présence juive est attestée à Habsheim dès la fin du XVe s. La communauté s'agrandit dans la seconde moitié du XVIIIe s. et juste vers 1870. La population juive représentait environ le dixième du nombre total des habitants et atteignait un maximum de 211 personnes en 1850. A cette époque, la communauté disposait d'une synagogue dirigée par un ministre officiant. Le siège du rabbinat était à Rixheim. Le nombre des israélites a fortement diminué à l'époque du Reischsland. En 1905, ils étaient trois fois moins nombreux qu'au milieu du siècle précédent. Des dissensions, cycliquement violentes, éclataient entre les deux collectivités, catholique et israélite. Le pillage et la destruction des maisons juives au cours de l'émeute des 27-30 juillet 1789 est peut-être à l'origine du départ de nombreuses familles vers d'autres régions: par exemple, une famille Picard de Habsheim s'est installée entre 1790 et 1792 à Dijon.
Si ces querelles relèvent en grande partie du rôle économique des Juifs (pratique de l'usure, monopoles de certaines professions telles qu'agents d'affaires, maquignons), qui entraînait, surtout lors des crises de subsistance, de vifs ressentiments de la part du paysannat catholique, elles étaient aussi dues à certaines discriminations fiscales ou autres (contributions aux impositions, exemptions du guet et de la garde, etc.). A noter aussi que la plus grande partie de la population israélite bénéficiait d'un enseignement hébraïque suivi.